این واحد مجهز به دو بخش شیمیایی و میکروبی است . دارای ۳ نفر پرسنل شامل کنترل کیفی،   مسئول فنی و مسئول آزمایشگاه می باشد 

آزمایشهای شیمیایی گندم و آرد شامل افت گندم، هکتولیتر گندم ، رطوبت گندم، گلوتن مرطوب،  گلوتن ایندکس آزمون زلنی  انجام می شود 

در بخش میکروبی آزمایش شمارش کلی ( توتال کانت)، کپک و کلسترید یوم پرفرانژانس انجام می شود .